中國(guó)科學(xué)院（簡(jiǎn)稱中科院）和中國(guó)中醫(yī)研究院（后更名為中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院）是兩個(gè)不同的科研機(jī)構(gòu)，它們分別代表著不同的研究領(lǐng)域和定位。

中國(guó)科學(xué)院是中國(guó)自然科學(xué)領(lǐng)域的最高學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)和全國(guó)自然科學(xué)與高新技術(shù)的綜合研究與發(fā)展中心，主要從事自然科學(xué)的研究工作，涵蓋了數(shù)學(xué)、物理、化學(xué)、天文、地理、生物、農(nóng)業(yè)、技術(shù)科學(xué)等多個(gè)學(xué)科。

中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院（原中國(guó)中醫(yī)研究院）則是專門從事中醫(yī)藥研究的事業(yè)單位，主要負(fù)責(zé)中醫(yī)藥的理論研究、臨床研究、中藥研究以及中醫(yī)藥的傳承與創(chuàng)新。

簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō)，中科院和中國(guó)中醫(yī)研究院在研究領(lǐng)域和定位上有所不同，中科院側(cè)重于自然科學(xué)，而中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院側(cè)重于中醫(yī)藥領(lǐng)域。兩者都是中國(guó)科研體系中的重要組成部分。